Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGER2P43116 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER2P43116 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms