Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTTP42858 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTTP42858 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTTP42858 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTTP42858 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTTP42858 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTTP42858 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTTP42858 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTTP42858 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTTP42858 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTTP42858 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTTP42858 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTTP42858 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
HTTP42858 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
HTTP42858 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTTP42858 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTTP42858 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTTP42858 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HTTP42858 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTTP42858 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTTP42858 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTTP42858 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTTP42858 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTTP42858 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTTP42858 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTTP42858 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTTP42858 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTTP42858 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTTP42858 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTTP42858 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTTP42858 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTTP42858 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTTP42858 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTTP42858 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTTP42858 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTTP42858 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTTP42858 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms