Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms