Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RYKP34925 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RYKP34925 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RYKP34925 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RYKP34925 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms