Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 KNTC1-206ENST00000534995 1065 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC025252.1-201ENST00000535247 556 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 ZNF714-203ENST00000596053 800 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC087893.1-201ENST00000612818 664 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 ANKRD66-202ENST00000565422 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 CLEC12B-201ENST00000338896 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 S100Z-202ENST00000513010 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC025419.1-202ENST00000535315 744 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AL352977.1-201ENST00000553464 453 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC104794.2-201ENST00000567540 1572 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC242988.1-201ENST00000611044 714 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 GEMIN2-202ENST00000308317 1420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 RPL6P8-201ENST00000490136 843 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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