Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTGFP29279 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTGFP29279 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTGFP29279 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTGFP29279 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTGFP29279 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTGFP29279 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTGFP29279 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTGFP29279 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTGFP29279 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTGFP29279 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTGFP29279 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTGFP29279 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTGFP29279 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTGFP29279 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTGFP29279 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTGFP29279 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTGFP29279 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTGFP29279 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTGFP29279 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTGFP29279 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTGFP29279 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTGFP29279 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTGFP29279 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTGFP29279 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTGFP29279 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTGFP29279 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTGFP29279 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTGFP29279 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTGFP29279 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTGFP29279 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTGFP29279 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTGFP29279 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTGFP29279 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTGFP29279 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTGFP29279 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTGFP29279 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTGFP29279 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTGFP29279 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTGFP29279 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTGFP29279 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTGFP29279 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTGFP29279 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTGFP29279 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTGFP29279 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTGFP29279 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTGFP29279 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTGFP29279 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTGFP29279 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTGFP29279 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTGFP29279 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTGFP29279 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTGFP29279 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTGFP29279 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTGFP29279 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTGFP29279 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTGFP29279 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTGFP29279 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTGFP29279 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms