Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXP28300 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LOXP28300 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXP28300 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms