Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDELR1P24390 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KDELR1P24390 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms