Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms