Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms