Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCFC2P16383 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms