Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms