Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN1P12814 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms