Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLBP1P12271 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms