Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP1P11387 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP1P11387 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TOP1P11387 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TOP1P11387 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TOP1P11387 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TOP1P11387 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP1P11387 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1P11387 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1P11387 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1P11387 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1P11387 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1P11387 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1P11387 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1P11387 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1P11387 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1P11387 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1P11387 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1P11387 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1P11387 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1P11387 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1P11387 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP1P11387 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms