Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms