Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NMBP08949 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NMBP08949 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMBP08949 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMBP08949 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMBP08949 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMBP08949 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMBP08949 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMBP08949 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMBP08949 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMBP08949 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMBP08949 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMBP08949 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMBP08949 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMBP08949 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMBP08949 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMBP08949 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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