Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms