Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEFMP07197 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFMP07197 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFMP07197 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFMP07197 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFMP07197 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFMP07197 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFMP07197 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFMP07197 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFMP07197 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFMP07197 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFMP07197 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFMP07197 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFMP07197 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEFMP07197 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEFMP07197 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEFMP07197 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFMP07197 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFMP07197 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFMP07197 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEFMP07197 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms