Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYBBP04839 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYBBP04839 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYBBP04839 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYBBP04839 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYBBP04839 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYBBP04839 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYBBP04839 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYBBP04839 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CYBBP04839 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYBBP04839 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYBBP04839 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYBBP04839 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CYBBP04839 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYBBP04839 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYBBP04839 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYBBP04839 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYBBP04839 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYBBP04839 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYBBP04839 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms