Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms