Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1O95476 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms