Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM2O94769 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM2O94769 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM2O94769 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM2O94769 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM2O94769 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms