Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN15O75808 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN15O75808 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms