Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms