Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms