Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRNO43815 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRNO43815 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRNO43815 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRNO43815 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRNO43815 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRNO43815 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRNO43815 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRNO43815 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRNO43815 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRNO43815 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRNO43815 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRNO43815 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STRNO43815 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRNO43815 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRNO43815 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STRNO43815 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRNO43815 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRNO43815 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRNO43815 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRNO43815 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRNO43815 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRNO43815 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRNO43815 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRNO43815 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRNO43815 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRNO43815 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRNO43815 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRNO43815 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRNO43815 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms