Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms