Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms