Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP3O43295 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP3O43295 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP3O43295 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP3O43295 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP3O43295 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP3O43295 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP3O43295 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP3O43295 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms