Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGFO15240 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGFO15240 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGFO15240 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGFO15240 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGFO15240 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGFO15240 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGFO15240 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGFO15240 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGFO15240 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGFO15240 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGFO15240 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGFO15240 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGFO15240 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGFO15240 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
VGFO15240 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGFO15240 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGFO15240 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGFO15240 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGFO15240 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGFO15240 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGFO15240 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGFO15240 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGFO15240 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGFO15240 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGFO15240 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGFO15240 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGFO15240 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGFO15240 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGFO15240 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGFO15240 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGFO15240 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VGFO15240 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGFO15240 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VGFO15240 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGFO15240 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGFO15240 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGFO15240 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGFO15240 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGFO15240 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VGFO15240 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGFO15240 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGFO15240 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGFO15240 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGFO15240 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGFO15240 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGFO15240 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGFO15240 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGFO15240 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGFO15240 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGFO15240 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGFO15240 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VGFO15240 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGFO15240 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGFO15240 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGFO15240 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGFO15240 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGFO15240 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGFO15240 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGFO15240 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms