Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARHGEF10O15013 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.2 ms