Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHOX2AO14813 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PHOX2AO14813 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms