Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms