Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCER2I3L3R5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms