Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms