Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DXG7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DXG7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DXG7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4DXG7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DXG7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DXG7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DXG7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DXG7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DXG7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DXG7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DXG7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DXG7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DXG7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DXG7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DXG7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DXG7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DXG7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4DXG7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4DXG7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4DXG7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4DXG7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms