Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOBPA7XYQ1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SOBPA7XYQ1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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