Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTL1A6NKG5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
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