Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF7

TMEM88B, Transmembrane protein 88B, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88BA6NKF7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM88BA6NKF7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM88BA6NKF7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms