Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms