Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms