Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC78A2IDD5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms