Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms