Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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