Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
MAP3K4Q9Y6R4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
MAP3K4Q9Y6R4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
MAP3K4Q9Y6R4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
MAP3K4Q9Y6R4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
MAP3K4Q9Y6R4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC40.28■■■■■ 4.04
MAP3K4Q9Y6R4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
MAP3K4Q9Y6R4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
MAP3K4Q9Y6R4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
MAP3K4Q9Y6R4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
MAP3K4Q9Y6R4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
MAP3K4Q9Y6R4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
MAP3K4Q9Y6R4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
MAP3K4Q9Y6R4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
MAP3K4Q9Y6R4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
MAP3K4Q9Y6R4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
MAP3K4Q9Y6R4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC40.2■■■■■ 4.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
MAP3K4Q9Y6R4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
MAP3K4Q9Y6R4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC40.16■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
MAP3K4Q9Y6R4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
MAP3K4Q9Y6R4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
MAP3K4Q9Y6R4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
MAP3K4Q9Y6R4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
MAP3K4Q9Y6R4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
MAP3K4Q9Y6R4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
MAP3K4Q9Y6R4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
MAP3K4Q9Y6R4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
MAP3K4Q9Y6R4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
MAP3K4Q9Y6R4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC40.05■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC40.05■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
MAP3K4Q9Y6R4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
MAP3K4Q9Y6R4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC40■■■■□ 3.99
MAP3K4Q9Y6R4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
MAP3K4Q9Y6R4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.3 ms