Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MSRAQ9UJ68 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MSRAQ9UJ68 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSRAQ9UJ68 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSRAQ9UJ68 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSRAQ9UJ68 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSRAQ9UJ68 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MSRAQ9UJ68 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSRAQ9UJ68 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSRAQ9UJ68 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSRAQ9UJ68 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSRAQ9UJ68 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MSRAQ9UJ68 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MSRAQ9UJ68 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSRAQ9UJ68 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms