Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL9Q9P2J3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL9Q9P2J3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL9Q9P2J3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms