Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RRN3Q9NYV6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRN3Q9NYV6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RRN3Q9NYV6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRN3Q9NYV6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms