Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DLL3Q9NYJ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DLL3Q9NYJ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DLL3Q9NYJ7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DLL3Q9NYJ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DLL3Q9NYJ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DLL3Q9NYJ7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DLL3Q9NYJ7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DLL3Q9NYJ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL3Q9NYJ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DLL3Q9NYJ7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DLL3Q9NYJ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DLL3Q9NYJ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DLL3Q9NYJ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DLL3Q9NYJ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DLL3Q9NYJ7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DLL3Q9NYJ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DLL3Q9NYJ7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DLL3Q9NYJ7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DLL3Q9NYJ7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DLL3Q9NYJ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DLL3Q9NYJ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DLL3Q9NYJ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DLL3Q9NYJ7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DLL3Q9NYJ7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DLL3Q9NYJ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DLL3Q9NYJ7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DLL3Q9NYJ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms